Приказом МАП № 389 от 13.06.55 г., выпущенным в развитие распоряжения Совета Министров СССР № 4652 от 9.06.55 г., образованное предприятие было тематически определено "...как специализированная научно-исследовательская организация по разработке и изготовлению астронавигационных систем управления" и поименовано, как Филиал № 1 НИИ-1. В дальнейшем название неоднократно менялось: отделение № 1 НИИ-923, филиал № 1 МИЭиА и, наконец, с 1979 года - МОКБ "Марс".
 Предприятие стало самостоятельным в 1989 г.
 Первым Главным конструктором был назначен Рубен Григорьевич Чачикян. С его именем связано образование конструкторского бюро и его становление в первые годы (1955-1959 гг.).
 В дальнейшем предприятие возглавляли: 1960-1974 гг.; 1979-1983 гг. - Валентин Леонидович Морачевский; 1974-1983 гг. - Николай Петрович Никитин (Директор) и Евгений Павлович Попов (Главный конструктор),
а с 1983 года по январь 2009 г. - Анатолий Сергеевич Сыров.

 Основной задачей было создание системы управления и навигации крылатой стратегической ракеты "Буря", испытания которой были начаты в 1961 г. Одним из главных фундаментальных достижений стала разработка следящей за звездами системы, работающей в любое время суток.

 Вскоре после закрытия работ по теме "Буря" на базе ФНИИ-1 Минавиапром организует отделение №1 НИИ-923 (п/я 228).
Начиная с 1962 года отделение № 1 НИИ-923 в течение нескольких лет последовательно выполнило разработку астросистем "Юпитер-М" и "А-31" для космических аппаратов
Е-6 и Е-8, чем и способствовало успешному выполнению "лунной" программы:
- мягкой посадки автоматической станции "Луна-9" на поверхности Луны – 31.01.66;
- доставки на Землю лунного грунта – 13.09.70 (Луна-16);
- высадки на поверхность Луны исследовательского аппарата "Луноход" – 10.11.70 (Луна-17).

 С 1978 по 1988 г. проводилась разработка алгоритмического и программного обеспечения системы управления и навигации орбитального корабля "Буран" на участке аэродинамического спуска с высоты 20 километров до посадки, включая пробег по взлетно-посадочной полосе и остановку. 15.11.1988 г. впервые в мире осуществлена посадка орбитального корабля в автоматическом режиме управления на заданный аэродром по траектории самолетного типа.